心肌梗死后心力衰竭大鼠左心室心肌基因组学特征的生物信息学研究

摘要

背景药物是心力衰竭(HF)治疗的基石,而基因组学技术正逐渐成为HF新药研发的关键领域之一。目的采用生物信息学工具分析心肌梗死后HF大鼠左心室心肌基因组学特征。方法在GEO数据库中选取假手术组(Sham组)和冠状动脉结扎诱导的心肌梗死后HF组(HF组)大鼠基因芯片,通过GEO2R在线软件筛选两组差异基因并对差异基因进行GO功能富集分析、KEGG Pathway富集分析及蛋白相互作用分析。结果 (1)筛选出表达上调、下调最显著的基因各20个。(2)GO功能富集分析结果显示,40个差异基因富集在细胞膜、内膜系统及细胞外空间等细胞成分中,可参与调控蛋白质结合、离子结合、转运活性等分子功能,涉及应激、多细胞生物过程、生理调节等多个生物学过程。(3)KEGG Pathway富集分析结果显示,40个差异基因主要参与心肌细胞中的肾上腺素能信号传导。(4)STRING分析结果显示,纤维粘连蛋白1、骨膜蛋白、结缔组织生长因子、分泌型磷蛋白1、成纤维细胞生长因子7、分泌型卷曲相关蛋白2等多个蛋白在相互作用网络中处于关键节点。结论应激、多细胞生物过程、生理调节等多个生物学过程及心肌细胞肾上腺素能信号传导通路参与心肌梗死后HF的发生发展。