广西柑橘衰退病和黄脉病调查及其病原病毒的遗传多样性分析

摘要

为明确柑橘衰退病毒(citrus tristeza virus,CTV)和柑橘黄脉病毒(citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)在广西柑橘上的发生、分布及其遗传变异情况,于2020年至2021年对百色、北海、崇左、贵港、桂林、河池、贺州、来宾、柳州、南宁、梧州和玉林等12个柑橘产区进行了病毒病调查。采用RT-PCR对采集样品进行了病毒检测,并基于病毒分离物外壳蛋白(coat protein,CP)基因的核苷酸序列进行比对分析,构建系统发育树。结果表明:采集的737份柑橘样品中,CTV的检出率为20.62%,CYVCV检出率为18.32%,CTV的检出率略高于CYVCV。病毒复合侵染的现象在采集的柑橘样品中普遍存在,CTV和CYVCV复合侵染率高达34.50%。对RT-PCR产物测序共获得12个CTV分离物和6个CYVCV分离物的CP基因序列。遗传多样性分析发现,CTV和CYVCV的CP基因序列都较保守,CTV分离物的遗传进化与地理来源、寄主来源均没有明显相关性,但CYVCV分离物的遗传进化与地理位置具有相关性,而与寄主来源无明显相关性。上述研究结果可为深入了解CTV和CYVCV在广西的流行情况以及柑橘病毒病的检疫和防控提供参考。