五种/株原甲藻核糖体小亚基(18S rRNA)基因克隆及序列分析

摘要

采用分子克隆及序列比对的方法,对五种/株赤潮原甲藻18S rRNA基因全长序列进行扩增、克隆和序列测定,并从GenBank上下载13个原甲藻18S rRNA基因接近全长的序列,用NJ法和ME法构建了原甲藻属的系统树.结果表明,五种/株原甲藻18S rRNA基因扩增序列长度为1782-1783bp,其中来自南海(中国海域)和来自美国海域的两株微小原甲藻(Prorocentrum minimum)的序列完全一致;东海的赤潮原甲藻(Prorocentrum sp.)与具齿原甲藻(P.dentatum)的序列也完全一致,与微小原甲藻只有5个碱基的差异;而海洋原甲藻(P.micans)与微小原甲藻和具齿原甲藻的序列差异较大,分别为27个和28个碱基.通过NJ法和ME法构建的系统树基本一致.由系统树可以看到:原甲藻属大致分为两支,本实验的微藻全部分布在同一支上.18S rRNA基因序列还将有助于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针的研制.