溶藻弧菌体外刺激泥蚶(Tegillarca granosa)血细胞后早期转录组研究

摘要

泥蚶(Tegillarca granosa)是我国传统养殖贝类,细菌性疾病导致的死亡已成为制约泥蚶养殖业发展的重要因素,血细胞是泥蚶免疫防御的执行者,血细胞能直接吞噬异物,能通过包囊作用将异物包裹,血细胞还在炎症反应和伤口修复中发挥作用。采用RNA-seq测序技术研究了溶藻弧菌体外刺激后泥蚶血细胞3 h和6 h时转录组动态变化,与未受刺激血细胞相比,3 h时1 790个基因表达发生显著改变,包括1 319个上调基因和471个下调基因;6 h时3 183个基因表达发生显著改变,包括2 629个上调基因和554个下调基因。KEGG通路富集分析发现溶藻弧菌刺激后免疫相关多个信号通路或生物学过程发生显著改变,如吞噬体、细胞凋亡、蛋白酶体、内质网加工、局部黏附等。部分免疫相关基因表达丰度3 h时变化不显著而6 h时发生显著改变,部分免疫相关基因3 h和6 h时表达丰度均显著改变。研究结果为泥蚶血细胞早期免疫反应提供了新的见解,为泥蚶抗病机理研究提供了理论基础。