基于ITS序列的胭脂萝卜亲缘关系分析

摘要

以胭脂萝卜为试材,采用PCR扩增其ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列,研究了序列同源性并构建系统发育树,以期为胭脂萝卜亲缘关系分析提供参考依据.结果表明:胭脂萝卜ITS1-5.8S rRNA-ITS2序列总长度为655 bp,ITS1 (G+C)含量为51.4％,长度为220 bp;5.8S rRNA(G+C)含量为53.4％,长度为217 bp;ITS2(G+C)含量为55.1％,长度为218 bp.胭脂萝卜与台北的Mei-Hwa、南京的Cd-03、台北的Mei-Nong、南京的Yang-hua、杭州的Baiyuchun、渥太华的SW77的同源性最高(99％),归为同一种.由系统发育树可得20个样品的总平均遗传距离是0.134,结合形态学特征表明待测胭脂萝卜可能由白皮白心萝卜进化而来.