HULC RNA在肝癌细胞中的表达及其对邻近基因SLC35B3表达的影响

摘要

目的探讨长片段非编码RNA——肝癌高表达基因（HULC）RNA在不同的肿瘤细胞系中的表达情况以及对其邻近基因表达的影响。方法应用反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）方法在不同来源的肿瘤细胞系中检测HULC RNA的表达情况,并通过生物信息学的方法寻找与其邻近的基因,再通过实时PCR技术检测HULC对邻近基因的表达情况的影响。结果在检测的8株细胞系:人胚肾细胞系293T,食管癌细胞系EC9706、KYSE150,结肠癌细胞系HCT116,肝癌细胞系SMMC7721、HepG2以及肺癌细胞系H446、H1229中,非编码RNA HULC在HepG2细胞中的表达量特异性升高。HULC基因的附近（＜1000 bp）没有编码基因存在,与其距离最近的基因是SLC35B3,且间距在约200 000 bp。与HULC RNA表达量较低的SMMC-7721细胞相比,内源性高表达HULC RNA的HepG2细胞中SLC35B3的转录更高[（0.477±0.040）%比（0.129±0.004）%,P＜0.01]。在SMMC7721细胞中转染pcDNA3.1-HULC质粒后,其邻近基因SLC35B3表达略微升高。而通过RNA干扰的方法敲降HULC RNA后,SLC35B3基因的表达也随之下降。HepG2细胞转染2条小干扰RNA（siRNA）后,SLC35B3基因的表达分别为[（0.283±0.007）%和（0.387±0.015）%],并且第1条siRNA转染后与阴性对照[（0.477±0.042）%]比较差异有统计学意义（P＜0.01）。结论肝癌细胞HepG2中特异性高表达的非编码RNA HULC对其邻近基因SLC35B3的表达有一定影响作用。