甲型H7N9流感病毒血凝素和神经氨酸酶的进化及抗原位点变异分析

摘要

目的分析甲型H7N9流感病毒的血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA）进化及其抗原位点变异。方法从美国国立生物技术信息中心（NCBI）和全球共享禽流感数据倡议组织（GISAID）数据库检索并下载从建库到2013年4月13日的H7N9病毒HA、NA的基因和氨基酸序列。应用ClustalW、MEGA 5.0、NetNGlyc 1.0 Server、DNAMAN等生物信息学软件,对HA、NA的基因序列和氨基酸序列进行比对分析以及预测其潜在的抗原位点。结果共有26条HA基因和氨基酸序列以及24条NA基因和氨基酸序列纳入分析。美洲地区的H7N9流感病毒HA、NA基因和氨基酸的保守性较亚欧地区高。HA、NA基因进化分为亚欧地区和美洲地区两大系。所有病毒HA裂解位点附近仅含1个碱性氨基酸R（Arg）。HA蛋白裂解位点和NA蛋白糖基化位点表现出地区差异,HA蛋白糖基化位点保守。HA、NA蛋白在亚欧地区和美洲地区有多个抗原位点发生变异。7例中国分离的新型H7N9病毒进化位于亚欧地区分支,NA的茎部在69~73位有5个氨基酸缺失,HA蛋白裂解位点、糖基化位点未发生变异,HA、NA蛋白多个抗原位点发生了与其他病毒株不同的变异。结论 H7N9病毒HA、NA进化表现出地区差异性。NA茎部氨基酸的缺失和HA、NA蛋白多个抗原位点的变异可能与人感染H7N9流感爆发有关。