基于分子对接与网络药理学预测防治新冠肺炎高频藏药潜在活性成分及其作用机制

摘要

目的基于分子对接和网络药理学方法,探究西藏自治区、青海地区高频藏药防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在活性成分及作用机制。方法从西藏自治区、青海省级卫生健康部门发布的防治COVID-19藏医方剂中筛选高频藏药,在TCMSP等数据库中搜集整理高频藏药成分及作用靶点,在Gene Cards数据库检索整理COVID-19相关蛋白。通过pubchem数据库下载高频藏药成分3D结构,采用Auto Dock Vina将其与新型冠状病毒SARS-Co V-2、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)两种蛋白结构进行分子对接。其次,通过STRING富集分析潜在活性成分与疾病交集蛋白、疾病自身相关蛋白的GO功能和KEGG通路,预测其防治COVID-19的可能机制。最后,预测潜在活性成分的药代动力学(ADME)特征,分析其研究应用价值。结果筛选出26个高频藏药中与SARS-Co V-2结合能<-35 k J·mol^(-1)或与ACE2结合能<-44k J·mol^(-1)的38个成分。其中Leptocarpinine、Dianthramide B、Tiliroside(银锻苷)等12个成分与两种蛋白的亲和力较强,可能防止或抑制新冠病毒蛋白入侵机体。且与COVID-19有31个交集蛋白,可能通过免疫调节、抗炎、提高细胞增殖功能、发挥抗病毒抗菌、抗凋亡等作用而防治COVID-19。结论西藏自治区、青海地区藏医推荐治疗新冠肺炎方剂中高频藏药具有防治COVID-19的潜在活性成分,其可能作用机制涉及多靶点、多通路,说明了藏医药抗SARS-Co V-2的可行性和科学性,为藏医药广泛用于治疗新型冠状病毒肺炎提供理论依据。