IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的结构基因组学分析

摘要

[背景]IncFII-FIA-FIB型质粒广泛存在于肠杆菌科细菌中,介导了许多耐药基因的水平转移,并导致细菌多重耐药问题日益严重.[目的]分析IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的基因组结构,并研究其介导大肠杆菌BTR株的耐药基因水平转移机制.[方法]利用PCR进行耐药基因筛查;接合转移和电转化实验验证质粒pBTR-CTXM是否具备自主接合转移的特性;VITEK 2 Compact全自动细菌鉴定及药敏分析仪测定相关菌株对抗生素的药物敏感性;构建Mate Pair文库并进行细菌全基因组高通量测序和质粒结构基因组学分析.[结果]菌株BTR是携带blaNDM-1、blaCTX-M-15、blaTEM、qnrD、qnrS1、mph(A)、erm(B)和tetA(B)等耐药基因的多重耐药大肠杆菌,其中blaCTX-M-15、mph(A)、erm(B)和tetA(B)等耐药基因均位于大小为144 939 bp的质粒pBTR-CTXM (GenBank登录号MF156697)上,该质粒可与菌株BTR内质粒pNDM-BTR接合共转移到受体菌大肠杆菌EC600中.pBTR-CTXM具备IncFII-FIA-FIB型质粒典型的骨架区结构,其多重耐药(Multidrug-resistant,MDR)区由新的复合型转座子Tn6492、Tn2残余、Tn10残余、ISEcp1-blacTx-M-15-△orf477转座单元和一些插入序列组成.[结论]pBTR-CTXM中新复合型转座子Tn6492与Tnl0残余和ISEcp1-blacTx-M-15-△orf477转座单元共同介导大肠杆菌BTR株的多重耐药与耐药基因的水平传播.