长沙A(H1N1)亚型季节性流感暴发疫情的实验室诊断及其HA基因特性分析

摘要

对2009年长沙麓山国际学校流感暴发疫情进行实验室诊断,并探索新分离的A(H1N1)亚型流感病毒血凝素(HA)的基因特性.对流感暴发疫情的25份鼻/咽拭子标本进行RT-PCR检测和流感病毒分离,然后利用CEQ 8000 Genetic Analysis System对病毒分离株(A/Yuelu/314/2009)进行测序,测序结果提交至GenBank(登录号:FJ912843)并用Clusta1X和Mega4.1软件进行序列分析.结果显示,分离出A(H1N1)亚型流感毒株18株,检出21份A(H1N1)亚型流感病毒核酸阳性;A/Yuelu/314/2009(H1N1)HA基因序列与2008～2009年疫苗株(A/Brisbane/59/2007)比较显示:核苷酸和氨基酸同源性均为99%,有6个位点的氨基酸发生了变异(V148A、S158N、G202A、I203D、A206T、W435R),其中一个S158N氨基酸变异位于B抗原表位,HA基因序列上共有潜在糖基化位点9个(27、28、40、71、151、176、303、497、536),与A/Brisbane/59/2007相同且氨基酸序列保守.本实验诊断出此次流感暴发疫情的病原体为A(H1N1)型季节性流感病毒,研究还发现A/Yuelu/314/2009(H1N1)长沙分离株与A/Brisbane/59/2007疫苗株基因序列比较显示并未形成一个新的变种,推测是由于分离株与疫苗株之间基因特性的改变和人群对A(H1N1)亚型流感病毒免疫力降低导致了此次长沙麓山国际学校A(H1N1)亚型流感的暴发.