全外显子组测序在9p缺失综合征诊断中的应用

摘要

目的探讨1例具有子宫发育不全而无面容异常和智力语言障碍的XX核型女性9p缺失综合征患者的临床及分子细胞遗传学特征。方法对患者及其父母行外周血染色体G显带核型分析,并对患者行全外显子组测序,分析9p末端缺失相关的临床表现、分子细胞遗传学特征及两者之间可能的关联性。结果该例9p末端缺失女性患者的临床症状主要为原发性闭经、幼稚子宫、性激素异常、癫痫等,未见三角头畸形和智力语言障碍等常见的9p缺失综合征典型症状。核型分析结果为46,XX,del(9)(p23),其父母核型未见异常。全外显子组测序结果显示,患者在9p24.3-p23(24846~13022661)区域存在单拷贝缺失,缺失片段长度约为13.0 Mb,覆盖了61个已知基因,包括DMRT1、DMRT3、DMRT2、DOCK8、KANK1、FOXD4等多个与9p缺失综合征表型密切相关的关键基因,在染色体其他区域并未发现其他致病性拷贝数变异(CNV)、碱基插入和缺失。结论9p末端缺失导致DMRT1基因单倍剂量不足可能是患者幼稚子宫、原发性闭经的主要致病因素。全外显子组测序提供了与临床表型相关的基因型背景数据。