基于ITS序列的DNA条形码技术鉴定红豆杉属植物

摘要

DNA条形码技术是一种快速、简便、准确的物种鉴定方法.本研究利用DNA条形码技术对南方红豆杉Taxus wallichiana var.maire样品Hi,H2,H3,H4;东北红豆杉T.cuspidata样品D1,D2和欧洲红豆杉T.baccata样品EU1,EU2八个样品的ITSl-18S序列进行PCR扩增和测序,将测序结果与GenBank中的同源序列进行比对分析.结果 表明,H1,H2,H3,H4与南方红豆杉的序列相似性最高,D1,D2与东北红豆杉T.cuspidata的序列相似性最高,EU1,EU2与欧洲红豆杉T.baccata的序列相似性最高.用邻接法(NJ)构建ITS1-18S序列的系统进化树(boostrap1 000次重复),结果表明,H1,H2,H3,H4和南方红豆杉聚为一枝;D1,D2与东北红豆杉聚为一枝;EU1,EU2与欧洲红豆杉聚为一枝.上述分析结果表明:H1,H2,H3,H4为南方红豆杉;D1,D2为东北红豆杉;EU1,EU2为欧洲红豆杉,与采集地样品信息完全一致.故可以利用引物ITS1-18S从分子水平区分红豆杉属Taxus植物.