基于宏基因组测序的橡胶林病原微生物的分析

摘要

为了解橡胶[Hevea brasiliensis(H.B.K.)Muell.-Arg.]林土壤和根系(根际和根表)广谱病原微生物的组成及其影响因素,以海南(儋州、万宁和乐东)和西双版纳(景洪、勐仑和勐满)地区健康橡胶林的土壤、根际和根表为材料,采用宏基因组测序技术,分析橡胶林病原微生物的组成及其影响因素。结果表明,植物病原微生物在门的水平为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和子囊菌门(Ascomycota);病原微生物在属水平为假单孢菌属(Pseudomonas)、劳尔氏菌属(Ralstonia)、伯克霍尔德氏菌属(Burkholderia)、链霉菌属(Streptomyces)、农杆菌属(Agrobacterium)、黄单胞菌属(Xanthomonas)、泛菌属(Pantoea)、麦角菌属(Clavibacter)、果胶杆菌属(Pectobacterium)和木质部小菌属(Xylella),在属水平上主要以子囊菌门为主。海南和西双版纳地区的根际病原微生物在属水平上无显著差异。土壤和根际样本病原微生物组成相似,各根表样本病原微生物组成相似,硝态氮与病原微生物呈显著正相关。