莼菜不同组织内生细菌多样性的比较分析

摘要

为研究莼菜内生细菌的多样性,挖掘莼菜的内生细菌资源,采用IlluminaMiSeq高通量二代测序技术对莼菜不同组织及水样进行了Alpha、Beta多样性分析,分析细菌群落的结构组成以及对比KEGG数据库进行内生细菌菌群基因功能预测.莼菜样品和水样中获得16S rRNA基因V3-V4区高质量序列1124709条,1391个细菌OTUs隶属于21个门和399个属.分析结果表明:莼菜内生细菌的优势菌群为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes),水样和莼菜组织间共有29个共有菌属,占内生细菌所有种类的7.27%.PICRUSt2功能预测发现内生细菌菌群共有34个子功能,菌群功能丰富,代谢为最主要的功能.莼菜茎的内生细菌多样性大于其他组织,且不同组织均有各自特异的菌属,推测植物组织结构可能会促进内生细菌选择合适的组织生态位为植物体提供动力.