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基于数据库挖掘分析BUB1基因在卵巢癌中的表达及意义

         

摘要

目的 探讨BUB1在卵巢癌(Ovarian cancer,OV)中的表达及与预后的关系.方法 利用Oncomine数据库挖掘BUB1在各种肿瘤中的表达;通过GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier数据库分析BUB1在卵巢癌中的预后价值;通过Coexpedia数据库构建BUB1在卵巢癌中的共表达基因网络,并用FunRich软件对score>13的共表达基因注释.利用WebGestalt对其进行KEGG通路富集分析.按score高低筛选出关键基因,GEPIA进一步分析BUB1与关键基因的相关性.结果(1)从Oncomine数据库检索出BUB1基因相关研究424项,其中高表达85项,低表达15项.(2)GE-PIA分析表明,BUB1在卵巢癌组织中的表达高于正常组织(P<0.05).(3)Kaplan-Meier数据库分析结果显示,BUB1基因低表达的卵巢癌患者总生存期(HR=1.2,P<0.05)增加.(4)BUB1的共表达基因主要有AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2、BUB1B、DEPDC1、KIF23、CDCA3、TTK、ASPM、BIRC5、HJURP、PRC1、CENPF、TOP2A、KIF20A、CCNB2、PTTG1和CCNB1.(5)其生物学功能主要涉及信号传导等;KEGG分析主要参与细胞周期等进程.(6)按score高低排序,筛选出4个关键基因,分别为AURKA、DLGAP5、KIF2C、TPX2.BUB1与AURKA(R=0.77)、DLGAP5(R=0.84)、KIF2C(R=0.81)和TPX2(R=0.76)的表达呈显著正相关.结论 在卵巢癌组织中BUB1呈高表达,且与患者预后呈负相关.

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