lincRNA AC099850.3在非肌层浸润性尿路上皮癌中高表达及机制研究

摘要

目的:探讨lincRNA AC099850.3在非肌层浸润性尿路上皮癌(NMIBC)中的表达和调控。方法:生物信息学筛选癌症基因组图谱(TCGA)数据库中差异性lncRNA。收集24例NMIBC手术中的正常组织和癌组织,体外培养人膀胱癌细胞系T24细胞,采用lincRNA AC099850.3的siRNA转染T24细胞,RT-qPCR测定基因表达情况。结果:生物信息学分析表达差异后得到156个上调lncRNA和69个下调lncRNA,其中61.78%为lincRNA,26.67%为反义lncRNA,11.56%为其他lncRNA。lincRNA AC099850.3上调最为显著,lincRNA AC099850.3高表达与不良预后显著相关(P=0.006)。与正常组织相比,癌组织中lincRNA AC099850.3表达明显升高(P<0.0001)。与lincRNA AC099850.3连接密切的2个miRNAs为miR-101-3p和miR-766-3p。功能富集分析显示,调控模块中的mRNA(FZD3、FZD6、COL4A1、LEF1和TCF7)可能对NMIBC的细胞周期至关重要。相对于正常组织,癌组织中miR-101-3p低表达,FZD3、FZD6、COL4A1和LEF1均高表达(P<0.05),lincRNA AC099850.3和miR-101-3p表达呈负相关(r=-0.662,P=0.001)。T24细胞转染siRNA干扰lincRNA AC099850.3后,相对于对照组和空载体组,T24细胞中lincRNA AC099850.3表达降低(P=0.002),miR-101-3p表达升高(P<0.0001),COL4A1表达降低(P=0.021)。结论:在NMIBC中,lincRNA AC099850.3高表达,可能是通过负性调控miR-101-3p促进肿瘤发展。