基于生物数据挖掘分析DKC1在肝细胞癌中的表达及其与预后的关系

摘要

目的:探讨先天性角化不良基因1(dyskeratosis congenita 1,DKC1)在肝细胞癌(HCC)中的表达及预后意义。方法:运用Oncomine、GEPIA分析DKC1在HCC组织中的表达情况,通过GEPIA分析DKC1与HCC患者生存期的相关性,利用STRING工具分析DKC1的蛋白相互作用网络。结果:Oncomine数据库中DKC1基因癌组织/正常组织表达量分析结果共有421项研究,在癌组织中显著高表达48项,低表达0项。其中有2项研究结果涉及DKC1在HCC与正常肝脏组织中的表达。与对照组相比HCC组织中DKC1 mRNA表达显著高于肝脏正常组织(P<0.05);利用GEPIA数据库生存分析功能发现,DKC1高表达与HCC预后呈负相关(P<0.05);通过STRING数据库构建蛋白互助网络图显示DKC1与NHP2、GAR1、NOP10、NOP56、NOP58、MPHOSPH10、NHP2L1、FBL、TERT、SHQ1等蛋白具有明显相互作用。结论:DKC1基因在HCC组织中高表达,DKC1表达与HCC患者预后相关,高表达患者预后差。