基于免疫相关基因构建肝细胞癌患者的预后模型及效果分析

摘要

目的:构建基于免疫相关基因的预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者预后的预后模型。方法:所有的组织样本均从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目下载。我们在R软件中对50例正常肝脏组织和373例HCC组织的所有免疫相关基因进行了差异表达分析。对所获得差异表达的免疫基因,使用单因素和多因素Cox回归分析,筛选出了预后相关基因并建立预后模型的风险评分(risk score)方程。随后,我们绘制了生存曲线、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线来评价模型的预测水平。此外,我们还将预后模型与多种临床信息进行单因素和多因素Cox回归分析,来判断模型能否作为判断HCC患者的独立预测因素。结果:基于单因素和多因素Cox分析我们得到了10个免疫相关基因,并构建了预后模型方程。生存曲线表明,风险评分越高的患者,其生存时间越短。ROC曲线显示这些模型的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.826。预后模型的风险评分可以独立于多种临床病理指标预测患者的生存时间。结论:我们的研究结果筛选了10个具有临床意义的免疫相关基因,这些基因可以作为HCC患者的潜在预后标志物,所建立的预后模型方程可以为患者的生存时间提供个性化的预测。