生物信息学分析FERMT1在膀胱癌组织中的表达及意义

摘要

目的:生物信息学分析FERMT1在膀胱癌组织中的表达水平及其与病理参数的关系,并进而挖掘其突变信息及调控网络。方法:首先利用GEPIA数据库分析FERMT1在多种癌症中的表达水平,进而利用Oncomine及THPA等在线网站分析膀胱癌组织中FERMT1基因的mRNA及蛋白质表达情况;利用在线UALCAN数据库展现FERMT1与临床病理参数间的关系;cBioPortal在线数据库分析FERMT1基因的突变情况;LinkedOmics软件探究与FERMT1共表达的基因及基因富集分析。结果:FERMT1在多数癌症中呈现高表达,在膀胱癌组织中mRNA及蛋白水平均发生明显上调,且FERMT1表达水平与膀胱癌临床病理参数密切相关;同时,FERMT1基因发生多种类型的拷贝数突变,其中错义突变最为常见;FERMT1与多种基因存在共表达关系,进一步的富集分析展示这些基因在多种生物学过程中发挥重要作用。结论:本研究有效地揭示了FERMT1在膀胱癌组织中的表达信息及潜在的调控网络,为进一步研究FERMT1在膀胱癌组织发生发展中的作用奠定了理论基础。