基于数据挖掘分析脑胶质瘤组织中VIM基因的表达及预后意义

摘要

目的:通过数据库挖掘来研究波形蛋白(Vimentin,VIM)基因在脑胶质瘤组织中的表达及其与临床预后的关系.方法:通过中国脑胶质瘤基因组图谱计划(Chinese Glioma Genome Atlas,CGGA)数据库(http://www.cgga.org.cn/)获取脑胶质瘤患者样本的mRNAseq数据及相应的临床数据,使用R(v.3.6.1)软件进行临床相关分析、生存分析、单因素和多因素Cox回归分析及ROC曲线评价VIM在胶质瘤进展中的预后作用,基因集富集分析VIM在脑胶质瘤中的功能,并行基因相关性分析.结果:分析发现VIM在脑胶质瘤组织中呈高表达,并与胶质瘤患者的不良预后相关;VIM可作为胶质瘤进展的独立预测因子.结论:VIM是预测脑胶质瘤患者预后的生物标志物,靶向胶质瘤VIM可能是抑制肿瘤进展的途径之一.