膀胱癌预后免疫相关风险模型的构建分析

摘要

目的:通过构建免疫相关风险模型用于评估膀胱癌(bladder cancer,BC)预后,探讨免疫相关基因(immune-related genes,IRGs)在BC临床应用价值.方法:基于TCGA、ImmPort、Cistrom等数据库分别下载BC转录组测序数据(RNA-seq)、IRGs和转录因子(transcription factors,TFs)数据,对差异表达的IRGs行COX回归分析,计算个体免疫-风险评分(RiskScore值)并行Kaplan-Meier生存分析,差异表达的IRGs与TFs进行网络调控分析,结合RiskScore值分析22种免疫浸润细胞在BC的差异表达.结果:共有22个IRGs与BC患者的临床预后显著相关,行KEGG分析显示细胞因子-细胞因子受体相互作用是IRGs最常见作用途径;以MMP9、PAEP、ADIPOQ、AHNAK、OAS1、RAC3、IL34、PDGFD、SH3BP2为基础构建的免疫-风险模型,行Kaplan-Meier生存分析提示低风险组生存预后明显好于高风险组(P<0.001);差异表达的16个TFs及7个IRGs纳入性网络调控分析,ENDRA、IGF1、RAC3作为调控网络的核心;基于IRGs的RiskScore值反映了多种免疫细胞浸润相关情况.结论:我们所构建的免疫-风险模型可用于预测BC患者生存预后,进一步研究发现BC中多种免疫细胞浸润情况,这可能有助于扩大免疫治疗的应用范围.