基于数据挖掘分析NETO2基因在头颈鳞癌中的表达及临床意义

摘要

目的:通过对相关数据库数据分析,探究头颈鳞癌组织中NETO2基因的表达情况和临床意义.方法:应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中528例头颈鳞癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析NETO2变异与头颈鳞癌患者生存之间的关系.利用UALCAN数据库网站搜索NETO2在头颈鳞癌组织及癌旁组织中的表达情况,以及NETO2的相关蛋白.结果:528例头颈鳞癌样本中有32例发生NETO2基因变异,变异率为6％,其中扩增5例(0.9％),错义突变2例(0.4％),节段突变1例(0.2％),缺失1例(0.2％),mRNA上调23例(4.4％).NETO2变异组总生存时间短于无变异组(P =0.009 21).NETO2变异组无病生存时间与无变异组差异无统计学意义.NETO2 mRNA在头颈鳞癌组织中的表达明显高于相应癌旁组织,差异有统计学意义(P＜0.001).S100A8、S100A9表达与NETO2表达呈负相关.结论:通过分析表明,NETO2基因在头颈鳞癌组织中表达上调,与头颈鳞癌患者预后相关,提示该基因在头颈鳞癌的发生发展中起到了一定作用,将为后续的肿瘤研究提供重要理论依据.