基于单细胞转录组测序数据分析PECAM1对胃肠道间质瘤细胞迁移和侵袭能力的影响

摘要

目的:探讨血小板和内皮细胞黏附分子1(platelet and endothelial cell adhesion molecule 1,PECAM1)表达对胃肠道间质瘤(gastrointestinal stromal tumor,GIST)细胞迁移和侵袭能力的影响。方法:基于GIST单细胞转录组测序数据,利用R语言筛选目标基因;细胞转染siRNA建立低表达实验组;伤口愈合实验、Transwell实验验证细胞迁移和侵袭能力的变化。结果:根据免疫细胞标志物PTPRC是否表达,将18个GIST细胞分群中的6个分群定义为非免疫细胞群;根据肿瘤干细胞标志物CD44、CD34和ABCB1的差异表达水平,将非免疫细胞群进一步划分成4个肿瘤干细胞亚群;对4个肿瘤干细胞亚群的差异表达基因作KEGG分析筛选出PECAM1基因;进一步基因集富集分析结果显示PECAM1与细胞迁移信号通路相关;细胞实验结果表明,相较于对照组,PECAM1表达降低后,细胞迁移和侵袭能力显著降低(P<0.05)。结论:PECAM1正向调控GIST细胞迁移和侵袭过程。