A类GPCRs变构过程的保守接触重排

摘要

应用氨基酸残基间的接触得分模型,分析了包含17个A类G蛋白偶联受体(G protein-coupled receptors,GPCRs)激活态和非激活态结构的残基对接触重排的保守性。不同于在较小数据集上所发现的34对保守重排,在新数据集上仅有4对残基存在一致的位置重排,且均为由非激活态到激活态的接触减弱类型。4对保守接触重排分布在5个螺旋的8个残基位置上,涉及位置均靠近G蛋白偶联区,远离配体结合区。保守重排的8个残基附近均存在序列保守性,这一现象符合“序列决定结构”的假设。当采用绝对满足接触得分模型设定的条件时,A类GPCRs不存在自配体结合区到G蛋白偶联区的保守的共同激活路径,保守变构很可能仅发生在靠近G蛋白结合区的位置,也表明A类GPCRs的变构表现出宏观的一致性和微观的特异性特征。