基于网络药理学和分子对接的葛根-灵芝-当归干预抗氧化机制研究

摘要

借助TCMSP数据库检索葛根-灵芝-当归中三味药材的活性成分和对应靶点,从Uniprot数据库查询靶点对应的基因名;通过GeneCards数据库查询抗氧化的相关靶点信息;利用Cytoscape软件构建成分-靶点网络图;运用STRING数据库构建靶点蛋白互作PPI网络,通过DAVID数据库对成分和抗氧化交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;使用Autodock软件进行分子对接,并利用PyMOL软件进行可视化处理.筛选到活性成分68种,对应109个靶点;抗氧化相关靶点982个;通过韦恩图获得交集靶点56个,主要为JUN、CASP3、CASP8、PPARG等.GO和KEGG富集分析结果表明,葛根-灵芝-当归可能通过老化、凋亡过程的负调控和抗缺氧的反应等方式干预抗氧化.分子对接结果显示复方中β-谷甾醇、刺芒柄花素、豆甾醇等成分均与JUN、CASP3、CASP8、PPARG等靶点有较好的亲和力.因此,葛根-灵芝-当归干预抗氧化具有多成分、多靶点、多通路特点.