基于宏基因组学研究怀地黄对鲤鱼肠道微生物群落组成的影响

摘要

鲤鱼(Cyprinus carpio L.)是我国淡水养殖鱼类的主要品种之一,其养殖过程中病害给养殖业带来重大经济损失.已有研究表明怀地黄(Rehmannia glutinosa,RG)作为饲料添加剂,具有提高鲤鱼免疫力和抵抗病害的功能,但机制尚不明确.利用宏基因组技术研究饲料中添加4%(质量分数)怀地黄对鲤肠道微生物群落组成的影响.结果表明梭杆菌门(Fusobacteria),变形杆菌门(Proteobacteria),拟杆菌门(Bacteroidetes),广古菌门(Euryarchaeota),奇古菌门(Thaumarchaeota),短尾噬菌体(Siphoviridae),肌尾噬菌体(Myoviridae),长尾噬菌体(Podoviridae),子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)是鲤肠道主要微生物类群.怀地黄可以增加鲤鱼肠道中益生菌、短链脂肪酸产生菌和产甲烷古菌的丰度,同时降低一些鱼类病毒的丰度.研究结果表明,饲料中添加怀地黄可以改善鲤鱼肠道微生物组成,提高有益菌的丰度而降低有害微生物的含量.研究结果为解析怀地黄增强鲤鱼免疫力的机制奠定了基础.