基于线粒体12S rRNA基因的大鹏半岛海域石珊瑚的系统发育分析

摘要

通过12S rRNA基因特异性扩增测序,对采自深圳大鹏半岛海域的16个石珊瑚样品的12S rRNA基因进行系统进化分析.研究结果表明:供试的16个样品来源于9种石珊瑚,12S rRNA序列的平均G+C含量为37.7%.通过最大似然法(ML)、邻位连接法(NJ)和最小进化法(ME)构建的系统发育树将9种石珊瑚聚类为2个大的分支:滨珊瑚科、菌珊瑚科、枇杷珊瑚科和鹿角珊瑚科的7种石珊瑚聚类一个分支;蜂巢珊瑚科的2种石珊瑚聚类为另一个分支,处于进化树基部.这2个分支的聚类验证了之前关于石珊瑚坚实型和复合型类群分类的研究.对比其他石珊瑚分子标记,本研究中的12S rRNA基因序列长度较长、基因变化速率快,分化程度较高,能够作为科以下亲缘关系鉴定的有效分子标记.