宽体金线蛭WpE基因的克隆及生物信息学分析

摘要

目的:克隆宽体金线蛭(WpE)基因,并进行生物信息学分析,为进一步研究宽体金线蛭药用价值提供理论基础。方法:从宽体金线蛭唾液腺转录组数据库筛选到WpE基因转录本,通过PCR反应验证WpE基因cDNA全长序列,运用生物信息学分析WpE基因碱基序列性质及其对应氨基酸序列的特性。结果:宽体金线蛭WpE基因碱基序列全长258 bp,编码85个氨基酸,其中包含一个由16个氨基酸组成的信号肽,成熟蛋白理论相对分子质量为8.093 kDa,理论等电点(PI)为5.85,该蛋白为亲水性蛋白,属于马铃薯抑制剂Ⅰ家族。结论:成功克隆出宽体金线蛭WpE基因,分析其序列的结构特征,该基因编码的蛋白质含有马铃薯抑制剂Ⅰ家族保守活性位点Asp46,其结合环能与胰凝乳蛋白酶结合并使其失活,具有抗炎与抗凝活性。