苦荞BAC文库的构建及BAC末端序列分析

摘要

目的:为了深入挖掘苦荞的基因组信息,筛选与苦荞品质相关的功能基因。方法:以苦荞品种"晋荞麦2号"为材料,参考Peterson等方法通过提取高分子量核DNA,经酶切、连接和转化构建苦荞基因组BAC文库;随机挑选48个BAC克隆进行序列末端测序。结果:该文库包括30 000个克隆,插入片段平均大小约为123 kb,空载率小于1%,覆盖苦荞基因组6.9倍。共得到89条BAC末端序列,通过序列比对分析发现,7条(8%)有比对结果。其中,有末端序列与rpoTm2、Trrap、MDR1等已知基因相似,这些基因与DNA锚定,物质跨膜运输和磷酸转移酶活性等功能有关。分析还发现末端序列40G19-F可能是苦荞基因组的重复序列。结论:苦荞BAC文库构建为今后苦荞基因的克隆及全基因组测序奠定了基础。