植物DXS基因的系统发育和分子进化分析

摘要

为了解DXS基因的系统发育、密码子偏好性和分子进化等特性,选取44个代表性物种的DXS基因序列进行分析。结果表明:DXS基因家族具有较高的保守性,序列间的平均遗传距离为0.243;DXS基因的分化时间先于对应的物种分化,DXS基因树和对应物种树的拓扑结构基本一致;所选的裸子植物和单子叶植物及同科的双子叶植物均分别聚类在一块;DXS基因的密码子偏好性较低,平均有效密码子数、GC3和G+C含量分别为47.25、0.49和0.51;DXS基因在进化过程中主要受纯化选择作用,野大豆DXS基因受到的选择压最大为0.981,黍属DXS基因受到的选择压最小为0.001,平均选择压大小为0.094;在各模型中均未检测到后验概率大于0.95的受正向选择作用位点;DXS基因的有效密码子数、GC3和G+C含量与选择压的大小均无显著的相关性。研究为进一步了解DXS基因的功能及其在MEP途径中的调控机制提供一定的理论基础。