卵巢癌基因共表达网络及预后标志物的研究

摘要

卵巢癌是一种早期诊断率低而致死率较高的恶性肿瘤,对其预后标志物的鉴定和生存率的预测仍是生存分析的重要任务.利用卵巢癌预后相关基因构建基因共表达网络,鉴定预后生物标志物并进行生存率的预测.首先,对TCGA(The cancer genome atlas)数据库下载的卵巢癌基因表达数据实施单因素回归分析,利用得到的747个预后相关基因构建卵巢癌预后加权基因共表达网络.其次,考虑网络的生物学意义,利用蛋白质相互作用(Protein-protein interaction,PPI)数据对共表达网络中的模块重新加权,并根据网络中基因的拓扑重要性对基因进行排序.最后,运用Cox比例风险回归对网络中的重要基因构建卵巢癌预后模型,鉴定了3个预后生物标志物.生存分析结果显示,这3个标志物能够显著区分不同预后的患者,较好地预测卵巢癌患者的预后情况.