等边浅蛤(Gomphina aequilatera)核糖体DNA第一内转录间隔区序列的特征分析

摘要

从浙江和福建沿海潮间带的6个采样点各随机选取2个等边浅蛤（Gomphina aequilatera）样品，以聚合酶链式反应、分子克隆和序列测定等分子生物学实验技术获得了ITS-1序列．通过比对发现，该序列内存在一个长度为17bp的插入／缺失片段和一个结构为（GA）3（GGGA）2（GA）4-6。的微卫星DNA，这2个结构是造成等边浅蛤ITS-1序列在个体基因组内及个体之间长度变化的主要原因．统计分析结果显示，该序列在个体基因组内的变异与相同采样点个体之间的变异无显著差异（P〉0．05），而与不同采样点个体之间的变异差异显著（P〈0．05），因此在种群水平的研究中是有效的分子标记．系统发生关系重建的结果和单倍型网络结构图均显示等边浅蛤的ITS-1序列各单倍型间的亲缘关系较近．