朗德鹅TLR4基因的生物信息学分析

摘要

为研究鹅TLR4的特征与功能,采用生物信息学方法对朗德鹅TLR4进行分析。结果表明,TLR4蛋白分子式为C_(4364)H_(6867)N_(1135)O_(1239)S_(32),定位于细胞膜,存在信号肽;含有8个LRR、1个LRR_CT、1个跨膜结构域以及胞内区的TIR;具有12个潜在的N-糖基化位点和89个磷酸化位点,可能与TIRAP和S100A9等具有相互作用。高级结构预测显示,该TLR4由α-螺旋、β-转角、延展链以及无规则卷曲组成。进化树分析表明朗德鹅与禽类亲缘关系较近,与其他物种则较远。研究表明朗德鹅TLR4蛋白是一种疏水偏碱性蛋白,符合TLRs家族典型结构,但在不同物种间存在一定差异性。