大鳞副泥鳅蛋白中血管紧张素转化酶抑制肽的计算机模拟评估

摘要

通过计算机模拟,预测大鳞副泥鳅生物活性以及其中血管紧张素转化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制肽的作用位点。通过UniProtKB数据库和蛋白质氨基酸序列比对选择大鳞副泥鳅蛋白,使用BIOPEP分析工具进行活性分析筛选出3种大鳞副泥鳅蛋白,使用Peptide、ExPASy和Predicted Antigenic Peptide等工具进行理化性质分析。将大鳞副泥鳅蛋白通过胃肠道模拟消化,分析释放的27种ACE抑制肽的一级结构、生物学潜力、理化性质和毒性特征。选择GPL和DGL进行分子对接。计算机预测方法确定出大鳞副泥鳅蛋白中具有28种生物活性,其中ACE抑制活性是主要活性之一。GPL与ACE活性位点S1、S2和S3成氢键相互作用,DGL与ACE活性位点S1和S2成氢键相互作用。