石榴查尔酮异构酶生物信息学分析

摘要

查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI)是黄酮类化合物合成途径中的关键酶之一.为了进一步研究查尔酮异构酶的结构和功能,利用生物信息学方法对石榴查尔酮异构酶进行分析.结果表明,石榴查尔酮异构酶为亲水性蛋白,呈酸性,无跨膜区域,没有信号肽,亚细胞定位于线粒体,具有磷酸化位点,但不存在糖基化位点,氨基酸序列具有chalcone 3查尔酮超家族保守结构域;二级结构预测显示,α-螺旋和无规卷曲是其二级结构的主要构成部分;同源建模法构建其三级结构模型,结果表明该模型与二级结构预测结果相符合,模型质量评估结果较好.