基于16S rRNA基因分析异育银鲫肠道微生物多样性

摘要

异育银鲫是我国主要淡水养殖鱼类之一。结合Illumina高通量测序技术和传统分离培养技术探究异育银鲫肠道菌群组成特点,以期为异育银鲫人工养殖环境的微生态调控技术开发提供指导。高通量测序分析结果表明,不投喂任何饵料的野生组和投喂商品化饲料的养殖组异育银鲫肠道微生物丰度及多样性水平差异不显著,但两组肠道菌群结构差异显著。在门水平上,养殖组厚壁菌门的相对丰度显著高于野生组,而变形菌门显著低于野生组(P<0.05);在属水平上,养殖组气单胞菌属、假单胞菌属和消化链球菌属的相对丰度均显著高于野生组(P<0.01),而红杆菌属的相对丰度显著低于野生组(P<0.01)。传统细菌分离鉴定结果表明,两组异育银鲫肠道中可分离培养细菌均以葡萄球菌属为主,其次为微球菌属;同时,从两组中均分离到芽孢杆菌属;野生组异育银鲫肠道经分离培养所得细菌种类多于养殖组。本试验结果将为异育银鲫健康养殖业的发展提供理论基础。