不同来源杀鲑气单胞菌毒力因子的比较基因组学研究

摘要

自凡纳滨对虾养殖水体中分离得到1株杀鲑气单胞菌YK-48,为确定YK-48与在鞍山养殖场金鱼体内分离出来的AS.17和烟台大西洋鲑体内分离出来的S68和S121等不同来源的杀鲑气单胞菌的毒力基因特征之间是否存在差异,对YK-48的形态、生理生化特征和药物敏感性进行分析,随后进行全基因组测序,对4株杀鲑气单胞菌进行基因组基本特征分析、毒力基因注释和耐药基因分析。通过系统发育分析发现,YK-48与AS.17聚类在一起,说明其为相同亚型中的同一克隆群。药敏试验结果显示,YK-48对利福平、杆菌肽、万古霉素和青霉素耐药。对毒力基因进行分析,菌株AS.17和YK-48的毒力基因结果基本一致;与S68和S121相比,抗吞噬作用和免疫调节相关表达的基因为AS.17和YK-48特有的基因;通过细菌黏附试验,验证了菌株YK-48不含黏附相关基因。通过基因组学对3种来源杀鲑气单胞菌进行比较,可为解析不同来源杀鲑气单胞菌毒力基因特征提供参考,并为其防控积累数据。