大鳞副泥鳅mtDNACytb基因序列分析及分子系统发育研究

摘要

对15尾大鳞副泥鳅的线粒体细胞色素b基因进行PCR扩增和正反测序,获得长度为1140 bp的细胞色素b基因同源片断.所有序列中共检测到15种单倍型,序列中共出现81个变异位点,总变异率为7.1％.各单倍型的变异全部是转换或颠换,无插入和缺失,转换／颠换比为6.36.变异位点在3位密码子中的分布呈现偏倚,密码子第3位的变异占总变异的85.18％,而第1和第2位均只占7.41％.A、T、C、G碱基的平均含量分别为27.4％、30.8％、26.5％、15.3％,A+T＞C+G.在所得序列中,密码子第1位上4种碱基使用较为均衡；第2位上碱基T的使用率高达41％,碱基G的使用率低至13.2％；第3位上碱基A的使用率为37.9％,而碱基G的使用率仅为7.0％.以红尾副鳅为外群用邻接法构建分子系统进化树.结果显示,在系统地位上大鳞副泥鳅与黑龙江泥鳅有较近的亲缘关系.