2019—2021年江苏地区PCV3感染情况调查及其Cap基因的遗传演化分析

摘要

为了解猪圆环病毒3型(PCV3)在江苏地区规模化猪场的感染及病毒演化情况,对2019—2021年收集的113份临床组织样品进行Cap基因的检测,应用DNAStar和MEGA软件对获得的序列进行遗传演化分析。结果显示:PCV3样品阳性率为37.17%(42/113),猪场阳性率为73.91%(17/23)。对29个阳性样品的PCR产物直接测序,显示核苷酸序列高度同源,同源性为97.3%~100.0%。挑取其中的12个阳性样品,扩增Cap全长序列,连接至pMD19-T平末端载体后测序,显示12条序列的核苷酸同源性为97.5%~99.8%,与国内外其他PCV3毒株Cap基因的同源性为97.0%~100%。遗传演化分析显示,3条序列与国内外PCV3亚群3a的毒株处于一个大的分支,6条序列属于3b,3条序列形成独立的分支(3c)。推导编码氨基酸后对24和27位氨基酸位点进行分析,1条序列为A24K27,2条序列为A24R27,9条序列为V24K27。本试验丰富了江苏地区PCV3感染的分子流行病学数据,为该地区PCV3感染的综合防控提供了科学依据。