新疆伊犁河谷博尔纳病病毒种系发生学分析

摘要

目的分析新疆伊犁河谷博尔纳病病毒(BDV)种系形成及其可能的原因。方法采用改进的巢式逆转录PCR(nRT-PCR)方法,在5个种属8个品种873例动物外周血单核细胞(PBMCs)中,检出伊犁马、新疆驴和哈萨克牧羊犬BDV磷蛋白(p24)RNA阳性片段19例,比对BDV标准株He/80、Strain V和H1766,分析核苷酸和氨基酸同源相似度,重构基因系统发生树。结果19例BDV p24核苷酸序列一部分形成伊犁独立支系,另一部分汇聚至伊犁-德国-瑞士混合支系。独立支系与标准株无聚合,核苷酸序列同源相似度为98%,氨基酸序列为100%;德国马He/80汇聚混合支系,核苷酸与氨基酸序列与He/80同源相似度均为100%。结论新疆伊犁河谷动物宿主中可能存在地源性BDV独立伊犁株,同一BDV感染不同种属动物可能源于外来疫病病原经草原丝绸之路的传播。