脓肿分支枝杆菌embB基因耐乙胺丁醇的分析

摘要

目的分析脓肿分支枝杆菌的embB基因,以探讨其耐乙胺丁醇的分子机制。方法用16S rRNA基因序列分析法鉴定5株脓肿分枝杆菌临床株,测定乙胺丁醇对临床株及标准株(ATCC 19977)的最低抑菌浓度(MIC)。PCR扩增embB基因的全序列,将所测序列进行生物信息学分析。结果乙胺丁醇对5株脓肿分支杆菌标准株和临床株的MIC均为128μg/mL,属高度耐药。从脓肿分支枝杆菌的标准株和临床株均扩增出约3 200 bp片段,与GenBank中脓肿分支枝杆菌标准株的embB基因大小一致。5株临床株与标准株比较,其核苷酸序列存在9个点突变,在突变位点所编码的氨基酸序列中,仅第18位、87位、770位密码子编码与标准株不同的氨基酸。6株脓肿分支枝杆菌的embB基因与对EMB敏感的结核分支杆菌标准株(H37RV)的相应基因序列比较,第303-305位密码子的核苷酸序列存在差异,但仅第303、304位核苷酸编码的氨基酸序列不同,第306位密码子的核苷酸序列无差异。结论脓肿分支杆菌对乙胺丁醇的耐药并非embB基因的突变所致,为embB基因天然存在结构的不同,属于天然耐药。结构的差异与第306位密码子无关,可能与第303、304密码子有关。