基于小RNA测序的甜樱桃病毒种类检测及鉴定

摘要

病毒病是甜樱桃的重要病害之一,利用高通量测序技术鉴定病毒病害种类,通过对2个表现“花脸”症状的甜樱桃样品YT-1和YT-2进行小RNA测序,并对获取的小RNA进行组装注释。结果表明,样品YT-1获得14190241条reads,鉴定到的主要病毒是樱桃小果病毒2,占小RNA的55.12%,还包括李属坏死环斑病毒、樱桃病毒病A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒、樱桃绿环斑驳病毒及啤酒花矮化类病毒;样品YT-2获得14954849条reads,鉴定到的主要病毒是李属坏死环斑病毒,占小RNA的59.05%,还包括樱桃病毒A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒及樱桃绿环斑驳病毒。