浙江新分离汉坦病毒ZT71株S基因片段的克隆及序列分析

摘要

目的为了获得浙江省汉坦病毒基因组更为详尽的资料,研究汉坦病毒的进化状况及变异程度,为疫苗病毒株的选择使用提供科学依据.方法本实验室利用RT-PCR方法扩增ZT71株S基因片段并克隆入质粒载体,进行核苷酸序列测定及分析.结果 ZT71株S基因由1754个核苷酸组成,只有一个开放读码框架,共编码429个氨基酸.与HTN型病毒(76-118)的核苷酸和氨基酸同源性分别为72.0%和82.6%,与SEO型病毒(SR-11、R22、Guo3、8610)核苷酸和氨基酸同源性分别为88.4%-96.5%和98.1%-99.0%,与其它型汉坦病毒的同源都很低.结论表明此分离的病毒为SEO型汉坦病毒,为进一步研究其进化和变异提供了有利条件.