3株H9N2亚型禽流感病毒基因组分子特征及遗传进化分析

摘要

为了解山东省活禽市场上分离的H9N2亚型禽流感病毒(AIV)的分子特征及遗传进化规律,试验选取本实验室分离鉴定的3株H9N2 AIV进行遗传进化分析,并对数据库中历年分离的H9N2毒株血凝素(HA)的关键氨基酸位点残基组成、变异趋势,以及分离株与疫苗株HA、NA基因的核苷酸差异性进行统计分析.结果显示:3株分离株的基因同源性依次为PB2 96.4％～96.8％、PB1 94.8％～97.6％、PA 96.3％～96.9％、HA 95.6％～98.0％、NP 97.3％～98.7％、NA97.3％～97.6％、M94.2％～97.8％、NS 97.4％～98.3％.PB1、NP、PA基因属于F98分支,M基因属于G1分支,PB2、NS 基因与早年分离的代表性流感病毒毒株的遗传进化关系比较远,形成单独的Unknown Avian分支.H9N2 AIV的HA蛋白第183位(对应H3亚型位置)由早年的H逐渐向N转化,第190位点主要比例由A向T转化,第226位氨基酸由早年的Q突变为L.本试验说明H9N2 AIV不断变异,与疫苗株的差异性逐渐增大,需对其关键位点变异及跨种间传播进行持续监测.