基于ChinaPca全基因组数据和基因表达量探讨LRP1对前列腺癌发病的影响

摘要

cqvip:目的探讨低密度脂蛋白受体相关蛋白-1(low density lipoprotein receptor-related protein-1,LRP1)基因对前列腺癌(prostate cancer,Pca)发病的影响。方法在ChinaPca GWAS数据中对9个LRP1的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)进行前列腺癌易感性验证;取前列腺癌组织标本12例、癌旁正常组织18例和前列腺炎组织4例进行免疫组化检测;对TCGA和GTEx数据库的LRP1基因表达数据进行分析;在String网站构建LRP1基因的交互作用网络。结果 ChinaPca GWAS数据分析显示,LRP1基因的rs11172113位点可能是前列腺癌遗传易感位点(P=0.083),TC基因型与Pca发病风险有关(OR=1.267,95%CI:1.066~1.505,P=0.007)。免疫组化检测和TCGA数据库分析结果显示,LRP1在前列腺癌组织和癌旁正常组织中的表达量差异无统计学意义(P>0.05),整合TCGA和GTEx数据库数据后LRP1在前列腺癌组织中的表达降低(P<0.05)。交互作用网络显示,LRP1与前列腺癌通路相关基因PLAT、PDGFB、PDGFRB有关联。结论 LRP1基因rs11172113位点可能是前列腺癌的遗传易感位点。LRP1基因在前列腺癌组织中呈低表达,可能通过调节PLAT、PDGFB和PDGFRB基因表达调控前列腺癌相关通路而导致前列腺癌发病。