嗜酸氧化亚铁硫杆菌中锌离子转运基因的鉴定与分析

摘要

cqvip:鉴定了Acidithiobacillus ferrooxidans DC(At.ferrooxidans DC)中与锌离子转运相关的4个ATP-binding cassette(ABC)transporter基因,并采用Reverse Transcription quantitative real-time PCR(RT-qPCR)技术分析在不同浓度的锌离子胁迫下这4个ATP-binding cassette(ABC)transporter基因在转录水平上的差异表达情况。然后利用Vector NTI、cluster X、BLAST、ORF Finder等生物信息学软件对各基因做进一步的生物信息学分析。结果表明:在锌离子胁迫下,4个ABC transporter基因(AFE_2435、AFE_2436、AFE_2437、AFE_2438)的表达量均有所上调,说明这4个基因对于锌离子的胁迫具有很强的敏感性。经生物信息学分析可知,基因AFE_2435和AFE_2436编码位于细胞质膜上的透性酶,AFE_2437编码位于细胞质膜上的ATP结合蛋白,AFE_2438编码位于周质空间的锌离子结合蛋白,这4个基因共同组成了一个与锌离子转运有关的ABC转运子。这些结果都表明这4个ABC transporter基因与DC菌中锌离子的转运有着密切的关系。