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不同阶段缺氧缺血性脑病大鼠大脑皮层信使RNAs及微小RNAs表达谱分析

         

摘要

目的 通过分析缺氧缺血性脑病(HIE)动物模型中信使RNAs(mRNAs)及微小RNAs(miRNAs)差异表达谱明确HIE发病过程中关键miRNAs及其调控途径。方法 18只新生7 d SD大鼠按随机数字表法分为缺氧缺血组及假手术组,每组9只;并进一步按照造模后不同时间分为0 h、1 d、7 d 3个亚组,每个亚组3只。缺氧缺血组大鼠采用改良Rice法制作HIE模型,假手术组大鼠仅分离左侧颈总动脉,不行血管结扎等操作。取2组大鼠大脑皮层120 mg行总RNA提取及质检、测序,建立mRNAs及miRNAs表达谱;同时应用在线靶基因预测软件TargetScan,miRanda和PITA对差异miRNAs和与之对应的同组mRNAs进行匹配,预测其信号通路和相关靶基因。结果 (1)对各组mRNAs测序结果进行富集分析发现,与同时间段假手术组比较,0 h组缺氧缺血大鼠mRNAs的生物学特征主要体现在细胞定位,细胞增殖迁移以及血管发育等方面,与补体、抗原呈递,肿瘤坏死因子信号通路以及细胞因子受体作用有关;1 d组缺氧缺血大鼠生物学特征主要体现在单一生物体信号,应对外界刺激以及血管发育等方面,与补体、抗原呈递,粘附以及细胞外基质受体作用有关;7 d组缺氧缺血大鼠生物学特征主要体现在细胞定位,单一生物体信号以及细胞粘附等方面,与补体、抗原呈递以及细胞因子受体作用相关。(2)将miRNAs测序中差异表达的miRNAs与同组mRNAs测序结果比对后发现rno-miR-181b-5p,rno-miR144-3p,rno-miR-873-5p,rno-miR-411-5p,rno-miR-132-3p,rno-miR-486,rno-miR-127-5p,rno-miR-6321的表达存在差异,且这些miRNAs主要参与HIE不同阶段的炎症反应及神经功能调节。结论 miRNAs可能通过复杂的负性调控网络调节炎症反应和神经功能,进而参与HIE的发生发展。

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