1株基因1型戊型肝炎病毒全基因组序列的测定及分析

摘要

目的对分离自新疆散发戊型肝炎（戊肝）患者的1株戊型肝炎病毒（HEV）W2-1全基因组序列进行测定和分析。方法应用RT-PCR分段扩增的方法获得W2-1的全长基因组序列;通过与GenBank中HEV代表株相比较,对其进行分型和基因同源性分析。结果 W2-1全长7212 nt,5′和3′UTR以及3个开放读码框（ORF1～3）分别为27、28、5079、1980和345 nt。序列分析表明,W2-1属于基因1型1b亚型,与引起1986—1989年新疆戊肝流行的HEV序列同源性为97.2%～98.5%,与2000—2008年我国分离到的1b亚型HEV同源性为97.6%～99.2%;其ORF1～3蛋白序列中含有区别于3型和4型HEV的特异性氨基酸位点。结论 W2-1属于1b亚型,新疆戊肝大流行之后1b亚型在我国人群中仍有传播,并且其基因序列稳定。