合并肺间质病变或恶性肿瘤皮肌炎患者的外周血差异基因表达分析

摘要

目的研究合并肺间质病变或恶性肿瘤的皮肌炎/临床无肌病性皮肌炎（DM/CADM）患者的差异表达基因及相关信号通路。方法 2017年1月至2018年1月于上海交通大学医学院附属瑞金医院皮肤科确诊的DM/CADM患者27例, 按照合并症状分为3组, 即合并肺间质病变组10例, 合并恶性肿瘤组8例, 无肺间质病变和恶性肿瘤组9例。同时收集7例健康对照。采用高通量RNA测序技术筛选上述4组受试者外周血中差异表达基因, 进行基因本体论（GO）分析以及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果与健康对照相比, DM/CADM患者4 820条基因表达上调, 137条基因表达下调;GO分析获得显著富集条目49个, 其中37个（75.5%）与生物过程相关;KEGG分析差异基因富集于感染、肿瘤以及免疫相关通路。与无肺间质病变和恶性肿瘤组相比, 合并肺间质病变组272条基因表达上调, 158条基因下调;GO分析获得显著富集条目157个, 其中114个（72.6%）与生物过程相关;KEGG分析差异基因富集于细菌感染和自身免疫/炎症通路。合并恶性肿瘤组398条基因表达上调, 68条基因表达下调;GO分析获得显著富集条目117个, 其中94个（80.3%）与生物过程相关;KEGG分析差异基因富集于糖基化、代谢以及肿瘤相关信号通路。结论 DM/CADM患者与健康对照组间、合并肺间质病变或恶性肿瘤的DM/CADM组与无合并症患者组间转录组基因及通路存在差异, 细菌感染、细胞因子/趋化因子通路在合并ILD的DM/CADM患者中显著富集, 而糖基化、蛋白代谢以及抗原提呈和自然杀伤细胞的细胞毒作用在合并恶性肿瘤的DM/CADM患者中显著富集。