Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

宋东光; 张辉松; 黄林旋; 刘尊良

首页> 中文期刊> 《生物信息学》 >Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

开具论文收录证明 >>

期刊封面封底目录下载 >>

文献代查 >>

页面导航

摘要
著录项
相似文献
相关主题

摘要

利用FreeBSD操作系统的文本过滤命令将NCBI的Genbank数据库的EST序列实现本地化导入到MySQL数据库中并能够进行更新,这利于对不同物种不同组织器官基因表达的分析.以水稻EST数据为例,对EST序列两端出现的polyA/T和载体序列亦进行了鉴别及去除,经过预处理的EST序列数据将为进一步进行EST聚类及基因表达分析提供可靠的保证.

著录项

来源
《生物信息学》 |2010年第1期|52-56|共5页
作者
宋东光; 张辉松; 黄林旋; 刘尊良;
展开▼
作者单位

佛山科学技术学院园艺系,广东,佛山,528000;

佛山科学技术学院园艺系,广东,佛山,528000;

佛山科学技术学院园艺系,广东,佛山,528000;

佛山科学技术学院园艺系,广东,佛山,528000;

展开▼
原文格式 PDF
正文语种 chi
中图分类各种专用数据库;基因理论;
关键词
EST; MySQL数据库; 更新; 预处理分析;

相似文献

中文文献
外文文献
专利

1. 基于酶序列数据库的本地化构建及应用 [J] . 刘江涛 ,周文卫 ,申铁 . 贵州师范大学学报（自然科学版） . 2017,第001期
2. 表达序列标签(ESTs)及其数据库 [J] . 徐琪 ,肖小珺 ,刘博 . 吉林畜牧兽医 . 2003,第010期
3. 基于皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)EST数据库的串联重复序列特征分析 [J] . 袁泽轶 ,张琳琳 ,张国范 . 海洋通报 . 2010,第001期
4. UNIX环境下ORACLE实时更新FORM的研究与实现 [J] . 樊兰非 . 计算机工程与应用 . 1997,第012期
5. 基于投影数据库的序列模式挖掘增量式更新算法 [J] . 陆介平 ,刘月波 ,倪巍伟 . 东南大学学报（自然科学版） . 2006,第003期
6. Unix系统下Oracle数据库自动备份方案 [C] . 王琦 ,黄密青 . 中国钢铁节能环保与自动化会议暨第十一届全国自动化应用技术学术交流会 . 2006
7. 水稻生物信息数据库及本地化生物信息分析平台的构建 [A] . 张利达 . 2002

Unix下EST数据库本地化更新及序列预处理分析

摘要

著录项

相似文献

相关主题

期刊订阅